В социальных сетях распространяется недостоверная информация о том, что Мурманский океанариум принадлежал городу Мурманску и был несколько лет назад продан в частные руки. Эти сведения не соответствуют действительности: океанариум никогда не был муниципальным учреждением.
В 1984 году в Мурманском морском биологическом институте РАН в п. Дальние Зеленцы была организована лаборатория по изучению морских млекопитающих, которые с 1992 года начали выступать на Семеновском озере под открытым небом, а с 1996 года океанариум открылся в нынешнем здании под эгидой института.
В 2006 году Мурманский морской биологический институт в связи с финансовыми трудностями прекратил финансирование. В январе 2007 года океанариум был куплен компанией «Арктиксервис» и получил новое название ООО «Арктиксервис — Мурманский океанариум».
В 2018 году учредителем ООО «Арктиксервис — Мурманский океанариум» стала компания «Север Строй», которой океанариум принадлежит до настоящего времени. Учредителем ООО «Север Строй» является Шанкоян Оганес Саркисович.